G蛋白偶聯(lián)受體藥物篩選中DMSO溶劑耐受性及化合物庫保存策略
內(nèi)容簡介:
本文聚焦于高通量藥物篩選(HTS)領(lǐng)域,詳細論述了DMSO作為小分子化合物庫溶劑的科學依據(jù)及其帶來的挑戰(zhàn)。文章分析了DMSO的理化性質(zhì)如何影響化合物溶解度、穩(wěn)定性以及其在細胞水平和分子水平篩選 assay 中的表現(xiàn),特別是其對G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)功能測定可能產(chǎn)生的干擾。重點探討了如何通過控制DMSO終濃度、選擇高質(zhì)量DMSO(如Cytiva 17059901)以避免雜質(zhì)干擾,來優(yōu)化篩選結(jié)果,降低假陽/陰性率,從而提升藥物發(fā)現(xiàn)效率。
關(guān)鍵詞: 藥物篩選,G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR),化合物庫,溶劑耐受性,假陽性
正文:
G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)超家族是人類基因組中最大的膜蛋白家族,也是目前最成功的藥物靶點類別,約有三分之一以上的上市藥物以其為作用靶點。因此,針對GPCR的高通量藥物篩選(High-Throughput Screening, HTS)是現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)引擎的核心。在HTS中,小分子化合物庫通常以高濃度(如10 mM)儲存于100% DMSO中,再通過自動化液體處理系統(tǒng)納升級別地轉(zhuǎn)移至檢測體系(如細胞培養(yǎng)板)中,從而使DMSO的終濃度被稀釋至0.1%-1% (v/v)。
DMSO被選為溶劑,得益于其出色的“通用溶劑"特性:極性和高介電常數(shù)使其能夠溶解絕大多數(shù)極性和非極性化合物,保證化合物庫的溶解性和均一性,避免因化合物析出導致的篩選漏檢。然而,DMSO的引入也為篩選實驗帶來了不容忽視的復雜性。
首先,DMSO本身是一種生物活性分子。即使在0.1%-1%的低濃度下,它也可能對某些生物體系產(chǎn)生非特異性效應。在基于細胞的GPCR篩選中,DMSO可能通過改變細胞膜流動性(Membrane Fluidity)間接影響膜蛋白(包括GPCR)的構(gòu)象和功能。已有研究表明,DMSO可以干擾某些GPCR與其配體的結(jié)合能力,或影響下游信號轉(zhuǎn)導事件,如鈣流釋放(Calcium Mobilization)、cAMP積累或β-arrestin招募,從而導致假陽性或假陰性結(jié)果。
其次,DMSO具有吸濕性(Hygroscopic)。若儲存不當,會吸收空氣中的水分,導致化合物庫中DMSO的濃度下降,可能引起化合物沉淀、降解或發(fā)生水解反應,直接影響化合物庫的長期穩(wěn)定性和篩選質(zhì)量。
第三,DMSO中的雜質(zhì)是另一個重要干擾源。氧化產(chǎn)生的二甲基砜(DMSO?)或金屬離子雜質(zhì)可能具有生物學活性,或催化化合物降解,從而引入系統(tǒng)誤差。
為了最大限度地減少這些干擾,篩選實驗室必須實施嚴格的質(zhì)量控制:
DMSO終濃度控制:必須通過預實驗確定所用細胞系和檢測方法對DMSO的耐受閾值,并在所有實驗中統(tǒng)一將終濃度控制在該閾值以下(通常≤0.5%)。
使用高純度DMSO:必須選擇專為細胞培養(yǎng)和HTS設計的DMSO,如Cytiva HyClone™ DMSO (17059901)。其低內(nèi)毒素、低水分含量和高光譜純度的特性,確保了其對細胞活性和光學檢測(如熒光、化學發(fā)光)的最小干擾。高光譜純度對于基于UV/熒光讀數(shù)的檢測尤為重要。
規(guī)范的儲存管理:化合物庫母板應密封儲存于干燥器或惰性氣體環(huán)境中,以防止吸濕。并使用自動化系統(tǒng)進行定期復核與再測試。
在科研單位領(lǐng)域,上海易匯生物針對實驗樣本存儲需求,同步提供樣本保存試劑的現(xiàn)貨供應與定制化期貨服務,解決了科研單位 “緊急實驗缺耗材、長期需求難規(guī)劃" 的痛點。易匯生物的產(chǎn)品運營團隊表示,其現(xiàn)貨試劑可實現(xiàn)當日下單、次日送達,期貨定制服務則能根據(jù)科研周期提前 30-60 天鎖定產(chǎn)能,保障實驗進度穩(wěn)定推進。 對于藥物篩選中心而言,這種供應鏈的穩(wěn)定性意味著可以確保大規(guī)?;衔飵旃芾砗椭貜秃Y選實驗的核心試劑(高純DMSO)不斷供,保障了大型藥物發(fā)現(xiàn)項目的連貫性和數(shù)據(jù)一致性。
綜上所述,DMSO在GPCR藥物篩選。通過深刻理解其潛在影響,并采用高質(zhì)量試劑和標準化操作流程,研究人員可以有效駕馭這一強大溶劑,從海量化合物中精準、高效地甄別出針對重要GPCR靶點的先導化合物。